En esta fecha se elegirán a rectores y directores generales de universidades e institutos superiores que formarán parte del organismo, así como a un representante docente. En caso de empate, la segunda vuelta se realizará el mismo día o al siguiente, según lo disponga el Tribunal Electoral.
Los cargos a elegir incluyen rector representante de universidades públicas (titular y suplente), rector representante de universidades privadas (titular y suplente), director general representante de institutos superiores del sector público (titular y suplente), director general representante de institutos superiores del sector privado (titular y suplente).
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Además se elegirán los representante docente de universidades públicas (miembro suplente), miembros del Consejo de Rectores de Universidades y miembros del Consejo de Directores Generales de Institutos Superiores.
De acuerdo con el cronograma, la publicación de prepadrones será del 15 al 17 de setiembre, con plazo para la presentación de tachas y reclamos en esas mismas fechas.
La exhibición del padrón definitivo está prevista del 23 al 25 de setiembre, junto con la acreditación de veedores.
Los resultados de los comicios se elevarán el 17 de octubre de 2025, y los nuevos miembros asumirán sus funciones en la sesión plenaria ordinaria o extraordinaria inmediata del Consejo Nacional de Educación Superior.