La sede apostólica había denunciado los hechos ante el Ministerio Público, luego de recibir varios testimonios de jóvenes que aseguraron haber sido víctimas de los abusos sexuales del sacerdote Caputo.
La denuncia contra Caputo se formuló el pasado 2 de mayo ante la ministra Alicia Pucheta, titular de la Corte Suprema, quien derivó el documento al fiscal general del Estado, Javier Díaz Verón.
Los antecedentes del caso refieren que Caputo se desempeñó como sacerdote por varios años en la iglesia San Cristóbal, hasta que en el año 2008 el monseñor Pastor Cuquejo, que estaba como arzobispo de Asunción, lo designó para cumplir funciones en la parroquia Virgen del Carmen de Villa Elisa.
La denuncia señala que supuestamente dos menores de la iglesia San Cristóbal fueron víctimas de abuso cuando el religioso ya cumplía sus nuevas funciones, dado que los niños y jóvenes de su anterior parroquia lo seguían visitando en esa localidad.