La auditoría de la Contraloría confirmó lo que ya se sabía, que la deuda de la binacional se originó en una decisión del Consejo de Administración de la entidad (a pedido de los brasileños) que fijó una tarifa inferior a la necesaria para cubrir sus cuentas, violando lo establecido por el Anexo C del Tratado de Itaipú.
Esto originó una deuda estimada en 4.193 millones de dólares, considerada espuria porque se debió a un pedido de Eletrobras, empresa propietaria de la mitad de Itaipú y a la vez principal acreedora de la entidad.
Este monto fue blanqueado en marzo de 1997 cuando la deuda (que seguía creciendo) fue dolarizada y con un doble factor de indexación, el factor de ajuste atado a la inflación de EEUU.
La doble indexación fue eliminada en 2007 tras un acuerdo entre los presidentes de Paraguay, Fernando Lugo, y de Brasil. Lula Da Silva.
El convenio entre los mandatarios, de seis punto, tambien incluía un aumento de lo que Brasil paga por la energía cedida por Paraguay y la posibilidad de que la Contraloría paraguaya auditara a la entidad, algo vedado hasta entonces con el argumento de la binacionalidad de la binacional.
Con el acuerdo Brasil también se comprometía a tomar en consideración el resultado de la auditoría paraguaya.
El documento final debe ser remitido por la Cancillería nacional a Itamaraty por lo que cualquier decisión sobre la deuda de Itaipú, una eventual quita, se decidirá en el terreno político.
Al 2011 las cuentas de la binacional ascienden a alrededor 16.000 millones de dólares se prevé que quede amortizada en el 2023..
