El Club Deportivo Santaní se fundó el 27 de febrero del 2009, luego de que la Liga Santaniana de Fútbol se proclamara campeona del Torneo Pre-Intermedia, en su primera versión.
De ese plantel que logró el ascenso a la Intermedia algunos jugadores se mantuvieron en estos cinco años, hasta lograr el anhelado ascenso. El Deportivo hace de local en el estadio del Unión Agrícola, club de la Liga Santaniana, con capacidad para 8.000 espectadores.
Según el presidente Néstor Arévalos, hará de local en ese mismo recinto durante su estadía en Primera, esperando recibir a los grandes.