La querella ante el juez Héctor Fabián Escobar, es por los delitos de calumnia e injuria. Como no hubo acuerdo de parte, decidirá si eleva o no el caso a juicio oral.
En una investigación contra Éver Cabrera, decano de Ingeniería, por cobro indebido de honorarios, por la fiscala Victoria Acuña, el ministro Peralta envío una nota donde acusó a ambas mujeres de querer sobornar a legisladores de la Comisión de Presupuesto. Sin embargo, luego se desdijo.
Además de la querella por parte de Barrios y Sánchez, tiene una denuncia ante la Fiscalía por denuncia falsa.
En la audiencia, Peralta reconoció la autoría de las notas, pero que lo hizo en carácter de ministro, y que tenía instrucciones del Ejecutivo de no conciliar, ni dar declaraciones.
