En los grupos de diplomáticos la noticia genera sorpresa porque es de público conocimiento que el funcionario había demandado al Ministerio de Relaciones Exteriores (MRE).
Juan Baiardi gozaba de la total confianza del canciller anterior Eladio Loizaga. Sin embargo, en enero de 2017, fue reemplazado en el cargo por Jorge Coscia Saccarello, pareja de la senadora colorada Lilian Samaniego y la representación consular fue elevada a la categoría de Consulado General. En mayo de 2019, durante la administración de Luis Alberto Castiglioni como canciller, se aplicó un sumario como consecuencia de un informe de auditoría interna practicada al Consulado en Foz de Yguazú, en 2018, que detectó algunas irregularidades. Concretamente faltas establecidas en la Ley de la Función Pública. Pero el resultado no fue concluyente y solo se le aplicó una multa simbólica.
Baiardi demandó luego al MRE por su traslado irregular al servicio local, sin que la decisión se tomara previamente en la Junta de Calificaciones. Así fue que estuvo un tiempo por Asunción, y antes de concluir la administración de Horacio Cartes, fue designado ante el Consulado en Santa Cruz, Bolivia, en 2018.
