Paraguay tiene algunos temas sobre los que la ex mandataria chilena, desde su cargo en la ONU, ha expresado preocupación como la falta de avances en la investigación de las muertes de dos niñas de once años, Lilian Villalba y Maria Carmen Villalba, durante un operativo de la Fuerza de Tarea Conjunta contra miembros del autodenominado Ejército del Pueblo Paraguayo (EPP), en la zona de Yby Yaú, en setiembre de 2020. Las niñas eran ciudadanas argentinas, por lo que existe también el reclamo del gobierno argentino de esclarecimiento del caso.
El hecho constituye un tema pendiente que cada tanto se reactiva en el ámbito internacional. Más aún, considerando que Paraguay es miembro del Consejo de Derechos Humanos de las Naciones Unidas. El boletín de prensa de Cancillería no indica cuáles son los resultados de la reunión de trabajo entre Bachellet y el embajador.