Filártiga ingresó en el 2008 al BCP a través de un concurso de méritos en el área jurídica. El candidato propuesto es abogado y cuenta con una especialización en derecho bancario realizada en Nueva York.
También trabajó en el Banco Mundial y desde hace dos años trabaja en el sector privado. El ministro de Hacienda, Benigno López, indicó que se presentó una lista de tres candidatos que fueron evaluados por el presidente Mario Abdo y se decidió la designación de Fernando Filártiga. El titular de Hacienda señaló que aguarda que el Senado convoque al candidato en la brevedad posible para la entrevista y preste su acuerdo constitucional al nombramiento.
De darse el acuerdo, Filártiga reemplazará en el cargo a Ernesto Velázquez Argaña, quien asumió en octubre del 2014 en sustitución de Rolando Arréllaga.