El sistema de competencia será el mismo que la temporada 2022, con 30 fechas, 15 en la primera rueda y 15 en la segunda; dos ascensos a Primera División y tres descensos determinados por los promedios. Además, se resolvió que en la categoría Reserva (Sub 20), cada equipo podrá incluir entre los titulares hasta 5 (cinco) jugadores que pasen la edad.
El campeonato de la División Intermedia 2023 tendrá la denominación Homenaje a Don Alejandro Dos Santos (dirigente ya fallecido del club 2 de Mayo de Pedro Juan Caballero) y arranca el viernes 31 de marzo.
En cuanto a la distribución geográfica de los equipos, 10 son de Asunción y Departamento Central y 9 del interior (ver infografía).