La Fiscalía habilitó el día de las votaciones el Centro de Monitoreo de Denuncias, para recibir reportes por irregularidades que sucedieron. De los casi 170 reportes, 44 ingresaron por Mesas de Denuncias Penales en todo el país.
La mayoría de las denuncias fueron por compra o venta de cédula (soborno al elector), por propagandas extemporáneas, por tomar fotografías durante la votación y por inducción al voto.
El departamento que más irregularidades registró es Alto Paraná, seguido de Asunción, Central, además de otras ciudades del interior.
Miembros de la Misión de Observación Electoral de la OEA acompañaron desde días antes para examinar las elecciones.