El Museo reúne documentos sobre la vida y las investigaciones realizadas por el francés, que vivió en esta localidad por diez años (1821-1831), durante el gobierno de Gaspar Rodríguez de Francia. Varios documentos son de puño y letra de Bonpland, ampliados de sus cuadernos de anotaciones para la exposición, además de una pequeña huerta con las plantas medicinales registradas por él.
Esta iniciativa responde a Denis Vène, ex embajador de Francia en Paraguay, entre los años 2004 y 2007, quien sede el inmueble a modo de préstamo. “El lugar honra la figura del sabio naturalista”, afirmó el embajador Luis Fernando Ávalos en conferencia de prensa. También dio lectura de la mención acerca del científico dada por Augusto Roa Bastos en su afamada obra Yo el Supremo. Aimé Bonpland (1773-1858) llegó a América con la expedición de Alexander von Humbold.