Godoy era miembro del Cuatrinomio de Oro durante la dictadura, conformado además por Mario Abdo Benítez, secretario privado de Stroessner; Sabino Augusto Montanaro (Interior) y J. Eugenio Jacquet (Justicia y Trabajo).
Godoy estuvo preso 5 años por enriquecimiento ilícito durante su gestión al frente del Ministerio de Salud Pública. En febrero del año 2014 fue la última entrevista que dio al menos a Última Hora en su edición impresa. En ella se declaró stronista y admitió que hubo una dictadura. Además aceptó que hubo torturas, pero que él nunca las presenció.
Godoy murió a los 93 años de edad. El único integrante del Cuatrinomio con vida es Jacquet. Todos los demás ya fallecieron, incluso Stroessner.